Les collections du musée et leur développement ont très naturellement évolué au cours des années écoulées depuis la création de l'institution.
Elles ont d'abord été constituées par le fonds donné par Chagall en 1972, qui reprenait la donation du Message Biblique de 1966 en y ajoutant tout le travail préparatoire ainsi que de nombreuses autres oeuvres : les gouaches de la Bible de 1931, les 105 gravures de la Bible ainsi que leurs cuivres, une importante collection de lithographies, dont les deux suites de lithographies bibliques issues de la revue Verve, cinq sculptures, dont deux importants bas-reliefs, une céramique. L'ensemble de cette donation de 1972 représente plus de 250 oeuvres.
Chagall a continué à enrichir les collections jusqu'à sa mort en déposant des exemplaires de ses livres illustrés au moment de leur parution ou des suites de ses illustrations (tirage séparé des illustrations, sans le texte).
La dation après le décès de l'artiste en 1988 enrichit le musée de dix tableaux bibliques, déposés par le Musée national d'art moderne, Centre Georges Pompidou, récipiendaire des dations. En 1986 et 1988, Charles Sorlier, lithographe attitré de Chagall chez Mourlot, fait don au musée d'un fonds abondant de lithographies à sujets bibliques et profanes.
La politique d'enrichissement des collections des conservateurs successifs du musée s'est peu à peu orientée vers une vision élargie à l'ensemble de l'oeuvre de l'artiste. Différentes acquisitions, achats, dépôts du Musée national d'art moderne, Centre Georges Pompidou, legs, permettent désormais au public d'accéder à l'ensemble de l'oeuvre.
Toutes les reproductions des oeuvres des collections sont disponibles sur le site de l'agence photographique de la Réunion des musées nationaux-Grand Palais : http://www.photo.rmn.fr
